Incluída no seleto Grupo de Excelência de Instituições de Ensino Superior do Ministério da Educação (MEC), a Universidade Santa Cecília (Unisanta) reafirma a qualidade de seu projeto pedagógico de graduação e de pós-graduação, de sua infraestrutura e do desempenho brilhante de seus atuantes professores, alunos, ex-alunos e funcionários. Apenas 9% das Universidades brasileiras fazem parte deste Grupo.

A Unisanta está em primeiro lugar no World Ranking (que avalia os trabalhos científicos das universidades de todo mundo) entre as Universidades na Baixada Santista. O ranking leva em consideração o número de citações das pesquisas das universidades por cientistas de outras instituições de diversas partes do mundo e o impacto delas nos meios acadêmicos e para a comunidade da região. Os dados constam do Google Scholar Citations Profiles, utilizado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Fapesp). O Ranking Web ou Webometrics é considerado o maior ranking do ensino superior. A responsabilidade é do Cybermetrics Lab (Spanish National Research Council, CSIC).